Военноморските сили изпълняват следните специфични задачи по мисиите на ВС:

В мисия „Отбранителна”

• Непрекъснато наблюдение и оповестяване за обстановката в морските пространства, контрол на корабоплаването, защита на морските комуникации и стопанската дейност на море;
• Участие в съвместни операции за отбрана на територията и морските пространства на Република България в системата на колективната отбрана;
• Участие в колективни отбранителни действия извън територията на страната ни (контра и антитерористични операции, патрулиране в назначени райони, ембаргови операции, ескортиране на особено ценни кораби и товари, противоминни операции и др. ).

В мисия „Подкрепа на международния мир и сигурност”

• Наблюдение, разузнаване за обстановката и контрол в зоната на операцията;
• Участие в съвместни и/или многонационални операции по борба с тероризма;
• Предотвратяване на незаконен трафик на хора, стоки и оръжия по море.
• Участие в ембаргови, хуманитарни, евакуационни и спасителни операции.

В мисия „Принос към националната сигурност в мирно време”

• оказване на съдействие на органите на държавната и местната власт за защита на населението, стопанството и инфраструктурата при кризи от невоенен характер и ликвидиране на последствията от тях;
• участие в защитата на важни стратегически обекти и морската критична инфраструктура;
• участие в борбата с организираната престъпност и трафика на наркотици, хора и оръжия
• участие в търсене и спасяване на хора на море и в хуманитарни и евакуационни операции.